宿坊の多くは宗教施設であることが多いです。
宗教施設であることから特定の信徒でないと宿泊できない場合がありますので前もって確認をとるようにしましょう。
また、敬意をはらい無礼のないよう気をつけましょう。
宿坊は和室が多く、ふすまだけで仕切られている部屋も多いので大声を出したり夜中まで騒いだりすると他のお客様に迷惑がかかりますので控えましょう。常に他の人に配慮した行動が求められることがあります。例えば食事やお風呂や門限など時間などの制約があります。常識的なマナーがあれば大丈夫。
朝からはお勤めやご祈祷がある寺社もあります。その他写経・滝行・読経・護摩行・座禅などを体験できるところもあります。お食事はお寺の宿坊では精進料理、神社の宿坊では産地の食材を使った郷土料理が提供されたりします。